Финал модуля. У нас есть смесь ДНК, РНК или белков, а найти нужно одну конкретную молекулу. В основе всех методов лежит одна идея — гибридизация. На ней стоят и блоттинг (ищем одно), и микрочип (проверяем тысячи генов разом).
Всё держится на комплементарности. Если взять короткую цепь-зонд, комплементарную искомой последовательности, она прилипнет только к своей паре. Осталось зонд пометить (радиоактивно или флуоресцентно), и мы увидим, где он сел. Это и есть гибридизация.
Классический метод, чтобы проверить, есть ли конкретный ген в образце ДНК. Пять шагов, и первые два нам уже знакомы.
Тот же приём работает для РНК и для белков. Меняется только то, что ищут, и чем метят.
| Блот | Что ищет · зонд |
|---|---|
| Southern | ДНК · комплементарная ДНК |
| Northern | РНК · комплементарная ДНК/РНК |
| Western | белок · антитело |
Порядок по сторонам света — South → North → West — и подсказывает пары: ДНК, РНК, белок. Только для белка зонд не нуклеиновая кислота, а антитело.
Микрочип — та же гибридизация, только сразу для тысяч генов. Это пластинка с множеством микроскопических ячеек, в каждой сидит зонд под свой ген. Ею сравнивают, какие гены активнее в опухоли, а какие в норме.
Компьютер считывает цвет каждой ячейки и строит профиль экспрессии. По нему можно подобрать терапию под конкретную опухоль.
Прочитай вопрос и подумай сам. Потом открывай по шагу, будто рядом преподаватель и спрашивает «а почему?».
Врачу нужно понять, вырабатывает ли клетка определённый белок — не просто есть ли ген в ДНК, а работает ли он до конечного продукта. Какой метод подойдёт?
Карточки подстраиваются под тебя: «легко» отодвигает повтор дальше, «снова» возвращает скоро. Прогресс хранится в браузере.