Биотех-методы начинаются с простого вопроса: как разделить и вообще увидеть ДНК, если она микроскопическая. Гель-электрофорез сортирует фрагменты по длине и работает не только с ДНК, но и с РНК и белками. С него начнём модуль.
Даже крупный фрагмент в 5000 пар, если его вытянуть, будет длиной всего 1–2 микрометра. Это тысячные доли миллиметра. Взять пинцетом и посчитать не выйдет, поэтому нужен способ рассортировать смесь фрагментов по длине, ничего не трогая напрямую.
Установка простая. Пластина агарозного геля (из водорослей) лежит в буферном растворе. С одного края — лунки, куда капают образцы, по краям — электроды.
Казалось бы, у длинного фрагмента больше заряда, значит и тянуть его будет сильнее. Но у длинного и масса больше, так что заряд на массу одинаков при любой длине. Решает размер. Гель — это сито, и короткие фрагменты проскакивают сквозь ячейки легче, поэтому уходят дальше.
Рядом обычно запускают ДНК-лестницу — набор фрагментов известной длины. По ней калибруют гель: смотрят, между какими ступеньками остановилась исследуемая полоса, и оценивают её размер.
Саму ДНК глазом не разглядеть, поэтому её метят красителем. Классика — бромистый этидий. Он встраивается между ступеньками двойной спирали (интеркалятор) и начинает светиться под ультрафиолетом.
Светящаяся полоса на геле — не одна молекула ДНК, а миллионы одинаковых молекул одного размера, доехавших до одной точки. Поодиночке их не увидеть, а вместе они дают яркий сигнал.
Прочитай вопрос и подумай сам. Потом открывай по шагу, будто рядом преподаватель и спрашивает «а почему?».
Криминалист сравнивает ДНК с места происшествия и образец подозреваемого. На геле у обоих полосы встали на одной высоте, набор совпал.
Карточки подстраиваются под тебя: «легко» отодвигает повтор дальше, «снова» возвращает скоро. Прогресс хранится в браузере.